Catalogue de Métadonnées du Health Data Hub
Lien vers le repo : Gitlab
Objectifs de l’algorithme
L’algorithme du Metadata Catalog vise à structurer, valider et publier des métadonnées conformes au modèle Health DCAT-AP. Il automatise la vérification de cohérence et l’enrichissement des jeux de données afin d’assurer leur interopérabilité entre institutions de santé.
Il est destiné aux organisations publiques, chercheurs et établissements de santé souhaitant décrire et partager leurs données de manière standardisée.
Son usage s’inscrit principalement dans le cadre du Health Data Hub français, mais peut être étendu à d’autres entités européennes participant à la mise en réseau des catalogues de données de santé.
Auteur(s)
Domaine médical
Méthodologie
La méthodologie du Catalogue de métadonnées repose sur une approche modulaire et interopérable, centrée sur les standards ouverts du Web sémantique (RDF, DCAT, SHACL). Le choix de ces technologies garantit la compatibilité avec les catalogues européens et facilite la validation automatique des métadonnées.
Le développement s’est appuyé sur une architecture orientée services : un backend FastAPI pour la gestion des métadonnées, Fuseki pour le stockage RDF, Keycloak pour l’authentification, et une interface React pour l’édition et la recherche.
Les principaux défis ont concerné la conformité stricte au modèle Health DCAT-AP, la gestion des performances lors de la validation SHACL et la synchronisation entre environnements locaux et cloud (S3).
À ce jour, le projet n’a pas encore fait l’objet de publication scientifique, mais s’appuie sur les spécifications officielles du Health DCAT-AP (European Commission, 2021) et du W3C DCAT 3.0 (2020).
Langage de programmation
Données utilisées
Données d'application
Validation
Date de dernière mise à jour
11/10/2025
Maintenance
L’application est maintenue par le Health Data Hub.
Comment installer l’algorithme ?
Installation en production (Helm)
Prérequis :
- Un cluster Kubernetes (≥1.23)
- Helm (≥v3) installé localement
- Accès à un registre d’images Docker et à un bucket S3 configuré
- Fichier de configuration values.prod.yaml adapté à votre environnement
1. Cloner le dépôt
git clone https://github.com/health-data-hub/metadata-catalog.git
cd metadata-catalog/helm
2. Création des values (exemple)
image:
repository: ghcr.io/health-data-hub/metadata-catalog
tag: latest
env:
S3_REGION: "eu-west-3"
S3_URL: "https://s3.eu-west-3.amazonaws.com"
S3_BUCKET: "hdh-metadata-prod"
S3_ACCESS_KEY: "<votre_access_key>"
S3_SECRET_KEY: "<votre_secret_key>"
ingress:
enabled: true
host: "catalogue.health-data-hub.fr"
keycloak:
url: "https://auth.health-data-hub.fr"
realm: "metadata"
3. Déployer avec Helm
helm upgrade --install metadata-catalog ./chart \
-f values.prod.yaml \
--namespace metadata \
--create-namespace
4. Vérifier le déploiement
kubectl get pods -n metadata
kubectl get ingress -n metadata
Crédits
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Licence et conditions d’utilisation
Ce projet est sous licence Apache License, Version 2.0.