SCOP

Ll’Inserm est un établissement public à caractère scientifique et technologique, placé sous la double tutelle du ministère de la Santé et du ministère de la Recherche. 

Deux unités Inserm sont impliquées dans ce projet :

• Le Centre de Recherche en Epidémiologie et Santé des Population (CESP, UMR 1018)
• Unité Cohortes épidémiologiques en population (UMS 11).

Contexte 

Les caractéristiques concernant les habitudes de vie des patients constituent souvent des facteurs de confusion pour de nombreux évènements de santé, et peuvent être injustement pris comme des facteurs explicatifs de ces évènements. Ils représentent à ce titre des facteurs d’ajustement incontournables dans de nombreuses études épidémiologiques. Parmi ces facteurs, se trouvent par exemple la consommation de tabac, d'alcool, la corpulence ou encore l'activité physique. Or malgré son exhaustivité, la base principale du Système National des Données de Santé (SNDS) ne dispose pas d’informations renseignant directement les habitudes de vie des patients. À défaut, les études utilisant cette base se basent alors sur des indicateurs proxy dérivés des données disponibles sur les remboursements de médicaments, les motifs d’hospitalisation, etc.

Ainsi, concernant la consommation de tabac, un algorithme a été proposé par le groupement d’intérêt scientifique EPI-PHARE, afin de définir le statut tabagique (fumeur, ancien fumeur, non-fumeur) d’un patient à partir de pathologies et/ou de médicaments associés à la consommation de tabac. Cet indicateur conduit à des taux de prévalence (pourcentage de fumeurs dans la population étudiée) du tabagisme relativement bas, suggérant que l'algorithme ne parvient pas à capter pleinement la consommation tabagique. Dans cette même publication, un indicateur binaire sur la consommation d’alcool est également proposé. Or à date, ces indicateurs n’ont pas fait l’objet de validation dans le contexte des données françaises, tandis qu’aucun algorithme visant à caractériser l’activité physique ou la corpulence n’a été développé pour la base principale du SNDS. 

Objectif du projet 

Le projet SCOP, porté par l’Inserm, vise à construire et évaluer des scores prédictifs pour quatre facteurs liés au mode de vie : la consommation de tabac, d'alcool, la corpulence et l'activité physique. Ce projet a pour ambition de faciliter l'implémentation de ces scores au sein de la communauté de la recherche, afin qu'ils puissent être utilisés comme des facteurs d'ajustement dans les analyses réalisées à partir de la base principale du SNDS.

Méthodologie et caractère innovant 

Le projet construit ainsi des scores prédictifs de facteurs liés au mode de vie à partir des données de la cohorte Constances, une cohorte épidémiologique généraliste chaînée aux données de la base principale du SNDS. Cette cohorte est riche d’enseignement pour le projet car, les participants sont invités, lors de leur inclusion dans cette dernière, à renseigner de manière précise un questionnaire portant sur leurs comportements de santé, comme leur consommation de tabac et d’alcool, ainsi que leur niveau d’activité physique. L’indice de masse corporelle (IMC) est calculé à partir des poids et tailles mesurés par des professionnels de santé lors de la visite médicale au moment de l’inclusion.

Les scores prédictifs portant sur l’IMC et l’activité physique seront ainsi construits grâce à la mobilisation de techniques avancées d’analyse de données issues de la base principale du SNDS, et les résultats seront validés à partir de la cohorte Constances. Enfin, les porteurs du projet mettront en œuvre la même stratégie d’évaluation pour les indicateurs de la consommation de tabac et de la consommation d’alcool précédemment développés dans la base principale du SNDS.  

Le projet SCOP a été lauréat de l’appel à manifestation d’intérêt BOAS 5. Dans ce cadre, l’apport de la Plateforme des données de santé (PDS) a consisté à fournir un accompagnement humain et financier.

Résultat / Livrable attendu

Les résultats de ce projet de recherche feront l’objet de publications scientifiques et de présentations à des congrès. L’ensemble des éléments de documentation ainsi que l’implémentation des algorithmes et de leurs sophistications sera mis à disposition sous licence libre permissive type MIT. Ces algorithmes seront également répertoriés dans la Bibliothèque Ouverte d’Algorithmes en Santé (BOAS) de la PDS.