THANATOS
Partenaires
- L’Assistance publique – Hôpitaux de Paris (AP-HP)
- L’equipe HeKA (Health data- and model- driven Knowledge Acquisition)
Contexte
Les maladies de l'appareil digestif font très souvent l'objet d'un traitement chirurgical avec près de 800 000 séjours chirurgicaux par an en France. Selon la DREES, la chirurgie digestive se place au troisième rang en termes de nombre de séjours hospitaliers toutes spécialités chirurgicales confondues. Cependant, les complications après une chirurgie digestive ne sont pas rares et peuvent avoir de graves répercussions sur l’état de santé des patients voire sur le risque de décès postopératoire.
La classification de la gravité d’une complication chirurgicale se base sur une échelle de référence mondiale : le score de Clavien-Dindo (CD). Le score CD est commun à toute spécialité chirurgicale car il prend en compte le traitement nécessaire pour soigner une complication et non pas la nature de la complication en elle-même. Ainsi, on parle de complications graves lorsque ces dernières nécessitent un traitement interventionnel, engagent le pronostic du patient et nécessitent un séjour en réanimation, ou lorsque le malade décède de cette complication. Ce score est validé et utilisé dans presque tous les essais contrôlés randomisés mais n’est pas disponible dans la base principale du SNDS.
Bien que la France enregistre un grand nombre de chirurgies digestives chaque année, avec une incidence élevée de complications postopératoires ayant des conséquences significatives sur les patients et le système de santé, aucun algorithme n'a encore été publié pour détecter les complications graves dans les données nationales. Certaines études françaises basées sur le PMSI ont proposé des scores de complications digestives, mais aucun de ces algorithmes n’a été validé en mobilisant une référence commune reconnue.
Objectif du projet
Le projet Thanatos est porté par l’AP-HP et l’équipe HeKA. Il vise à développer et valider un algorithme fiable d’identification, dans la base principale du SNDS, des complications postopératoires graves dans les 30 jours après une chirurgie digestive selon le score de CD.
Méthodologie et caractère innovant
Le développement de l’algorithme sera fait avec l’utilisation des données du PMSI (Programme de Médicalisation des Systèmes d'Information) et de l’INSEE incluses dans l’entrepôt de données de santé (EDS) de l’AP-HP. L’algorithme sera nativement utilisable au sein de la base principale du SNDS qui contient les mêmes variables. L’EDS, en plus des données médico-administratives, contient les données cliniques et textuelles nécessaires qui permettront d’extraire un score précis pour chaque patient, d’établir le Gold standard (méthode de référence) et de valider l’algorithme.
Le projet THANATOS a été lauréat de la sixième vague de l’appel à manifestation d’intérêt Bibliothèque Ouverte d’Algorithmes en santé (BOAS). Le projet BOAS a été initié en 2021 pour favoriser le développement et la mise en open source d’algorithmes de ciblage facilitant la manipulation des données de santé à des fins de recherche. Dans ce cadre, le Health Data Hub accompagne le projet de manière réglementaire, juridique et financière.
Livrable(s)
Le projet Thanatos permettra ainsi l'enregistrement d'une information standardisée utile pour toutes les études scientifiques réalisées à partir des bases de données de santé. Utilisable au sein de la base principale du SNDS, l'algorithme développé et validé sera mis en open source dans la BOAS afin de bénéficier à l’ensemble de la communauté scientifique. Ce dernier pourrait par exemple également faire partie et compléter des indicateurs de vigilance en chirurgie publiés par la HAS en 2023.