Combiner intelligence artificielle et expression des gènes pour prédire la réponse aux inhibiteurs de PARP dans le cancer de l’ovaire
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Le cancer séreux de haut grade de l’ovaire est associé à une mortalité importante et, malgré l’efficacité des inhibiteurs de PARP (PARPi), certaines patientes présentent une résistance à ces traitements.
Ce projet de recherche ancillaire à l’essai PAOLA-1 vise à identifier, à partir de données de pathologie numérique et de données transcriptomiques, des caractéristiques tumorales associées à la sensibilité aux PARPi. L’objectif est notamment de développer des algorithmes d’intelligence artificielle capables d’identifier des profils morphologiques associés aux caractéristiques moléculaires des tumeurs et d’évaluer leur capacité à prédire le bénéfice de l’olaparib.
Le projet repose sur l’analyse rétrospective des données et échantillons issus des patientes incluses dans l’essai PAOLA-1 "Etude de phase III, multicentrique, randomisée, en double aveugle, comparant Olaparib vs Placebo chez des patientes présentant un cancer avancé de l’ovaire, des trompes de Fallope ou du péritoine de stade FIGO IIIB-IV, séreux ou endométrioïde de haut grade, traitées en première ligne par chimiothérapie associant un sel de platine et un taxane avec le bevacizumab pendant la chimiothérapie puis en entretien". Les analyses associeront des images de lames histologiques tumorales numérisées, des données d’expression génique obtenues par RNA-seq et des données clinico-biologiques. Des méthodes de pathologie computationnelle et d’intelligence artificielle seront utilisées conjointement à des analyses transcriptomiques et statistiques afin d’étudier les associations entre caractéristiques morphologiques, moléculaires et cliniques.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
L'année et le mois de naissance sont nécessaires pour calculer l'âge des patientes au moment du diagnostic et du traitement, variable importante pour la description de la population étudiée et les analyses statistiques. Les dates de soins et de décès sont indispensables pour déterminer les durées de suivi et les critères de survie (notamment la survie sans progression et la survie globale), qui constituent des variables essentielles
à l'évaluation des nouvelles méthodes d'analyse développées dans cette étude.
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
10
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Transfert des données personnelles vers la Suisse, pays en règle avec le RGPD.
Droits des personnes
Les patientes peuvent faire valoir leurs droits RGPD auprès de leur médecin, qui se chargera de contacter le DPO d'ARCAGY en lui donnant seulement le code patiente. Le DPO traitera la faisabilité de la demande de droits et reviendra vers le médecin. Ce dernier relaiera la réponse à la patiente.