Développement de diagnostics médico-légaux fondés sur le microbiome _ Forensic-Dx

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

Les méthodes forensiques actuelles d'identification des fluides corporels s'appuient sur des marqueurs biochimiques, génétiques ou épigénétiques qui manquent souvent de robustesse lorsque les échantillons sont dégradés, mélangés ou présents en faibles quantités. Parallèlement, les études à grande échelle sur le microbiome humain ont démontré que les différents sites corporels sont caractérisés par des communautés microbiennes hautement spécifiques et reproductibles. Ces signatures microbiennes constituent une source d'information prometteuse, encore sous-exploitée, pour les applications forensiques.
Le projet Forensic-Dx s'appuie sur cette spécificité biologique pour développer des signatures microbiennes diagnostiques capables d'identifier le site corporel d’origine des échantillons biologiques humains couramment rencontrés dans les investigations judiciaires. En combinant une collecte standardisée des échantillons, un profilage métagénomique et des approches d'apprentissage automatique (*machine-learning*), le projet vise à établir des classificateurs fiables et interprétables, applicables aussi bien aux échantillons purs qu'aux mélanges.
L'objectif de ce projet est de développer une nouvelle méthode en médecine légale permettant d'identifier sans ambiguïté (« diagnostiquer ») l'origine anatomique de différents fluides biologiques humains, tels que le sang périphérique, le sang menstruel, la salive, le mucus nasal, les sécrétions vaginales et les matières fécales.

Ce projet apporte un bénéficе dirеct à la société via la justicе pénalе, еn fournissant dеs prеuvеs sciеntifiquеs fiables sur la provеnancе dеs tracеs biologiquеs, еssеntiеllеs à l'établissеmеnt objеctif dеs faits еt à la rеconstruction dеs scènеs dе crimе.
L'еffort dе transparеncе sciеntifique est guaranti par la valorisation systématiquе dеs résultats via dеs publications еt dеs communications dans dеs congrès spécialisés. Les pipelines bioinformatiques développés seront intégralement versionnés et documentés pour assurer la reproductibilité et faciliter le transfert de technologie vers les laboratoires forensiques. Les éventuels partages de données avec des tiers s'effectueront exclusivement via des accords de transfert de matériel (MTA/DTA) standardisés.

L’étude prévoit l’inclusion de 30 participants au maximum. Les échantillons concernés sont le sang, la salive, les matières fécales, le sperme, le sang menstruel, le liquide nasal, le liquide oral, le liquide vaginal et l’urine. Les femmes devront accepter de réaliser au minimum deux prélèvements, dont un prélèvement de sang menstruel. Les hommes devront accepter de réaliser au minimum deux prélèvements, dont un prélèvement de sperme. Les femmes et les hommes pourront également réaliser au minimum deux prélèvements, dont un prélèvement de matières fécales. Les échantillons seront recueillis dans le tube ou dispositif de prélèvement approprié selon le type d’échantillon.
Les analyses seront réalisées après extraction de l’ADN par séquençage à haut débit et identification de la composante microbienne des échantillons.