EPIDORé : Comparaison des Staphylocoque doré isolés chez les animaux et leur viande et dans des prélèvements humains

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

En France, aucune surveillance de la colonisation à S. aureus est réalisée chez la volaille et les études chez les bovins sont essentiellement réalisés sur des animaux malades (essentiellement les mammites). Cette surveillance n’est pas réalisée car le risque de transmission de S. aureus de l’animal à l’homme est rendu peu probable par les experts dans un mode d’agriculture moderne où la promiscuité avec les animaux est plus faible que dans d’autres pays, et la transmission par la viande animale à l’homme est considérée comme anecdotique. Cependant une étude rétrospective réalisée au Danemark a permis de mettre en évidence un possible lien entre ces souches de SAMR CC398 et la viande de volaille dont un prélèvement de viande était d’origine Française. Notre étude aura donc pour but d’évaluer la prévalence de S. aureus CC398 chez l’homme et l’animal et d’estimer le potentiel risque de transmission de l’animal à l’homme de ce clone plus virulent que le clone initial décrit provenant du cochon. En cas de lien génétique entre les souches animales et humaines, des messages d’hygiène pourraient être rappelé aux usagers. En effet l’hypothèse la plus probable de la transmission de la viande à l’homme serait lors de la manipulation de la viande crue lors de la préparation du repas. Un message de rappel simple sur le lavage des mains après manipulations de la viande et lavage du plan de travail pourrait être réalisé.
Les objectifs sont :
- D’évaluer la prévalence et l’origine génétique associés aux souches SAMR CC398 isolés de prélèvements humains et animaux (porcs, volailles, bœufs) vivants et dans la viande prête à la consommation.
- D’évaluer les facteurs cliniques et démographiques associés aux infections humaines à SAMR CC398
La population d’étude est :
- Les patients avec colonisation ou infection à SAMR hospitalisé dans un hôpital de la région Franche-Comté.
- Pour les animaux : sélection de 5 fermes avec élevage de porcs, bœuf ou volailles pour prélèvements de l’environnement.
- Pour la viande : Prélèvement de viandes prête à la consommation en super marché mais également dans les lieux de vente direct des fermes sélectionnés auparavant.