Etude ANRS GAMMACOV : Réponses humorale et lymphocytaire T à la vaccination contre le SARS-CoV-2 chez les sujets présentant un déficit immunitaire humoral primitif - Etude menée sur données de la cohorte ANRS COV-POPART et dossiers médicaux du CHU de

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

La cohorte COV-POPART (Etude ANRS0001S COV-POPART) a comme objectif de suivre la réponse humorale à la vaccination contre le SARS-CoV-2 dans le temps dans différentes sous-populations dites fragiles (patients avec hypogammaglobulinémie, patients cancéreux, greffés, obèses, insuffisants rénaux, patients vivant avec le VIH, diabétiques, etc…) et offre la possibilité d’étudier la réponse immunitaire à long terme (24 mois après la 1ère vaccination). Les participants, suivis 2 ans, ont bénéficié de la vaccination (au moins 2 doses d’un vaccin ARNm pour la très grande majorité) puis ont été prélevés au moment de la 2ème dose si applicable (M00), 1 mois post dose n°2 (M01), 1 mois post dose n°3 (M02) (si applicable), 6 mois (M06), 12 mois (M12) et 24 mois (M24) après la dose n°2 afin de déterminer leurs taux sériques d’anticorps anti-Spike (Ac anti-S), d’anticorps anti-RBD et d’Ac neutralisants.
La sous-population Hypogammaglobulinémie de la cohorte comprend 101 patients, des déficits de l’immunité humorale primitifs (DIHP) pour deux tiers d’entre eux. D’après les résultats publiés en 2023 dans CMI (P. Loubet et al), ayant porté sur l’analyse des données de 70 patients de la sous-population Hypogammaglobulinémie, la réponse humorale (taux d’Ac anti-S et Ac neutralisants) à 4 semaines après la 2e dose d’un vaccin ARNm (BNT162b2 dans 95% des cas) était significativement moins bonne que dans toutes les autres sous-populations de la cohorte, hormis les patients transplantés d’organe qui développaient une réponse humorale inférieure. Ainsi, des taux positifs d’Ac anti-S ont été détectés chez 77,1 % (IC95 % : 65,6-86,3) des patients avec seulement 33,3 % (IC95 % CI : 21,1-47,5) de forts répondeurs. Les taux étaient équivalents pour les Ac neutralisants [72,9 % (IC95 % : 60,9-82,8)]. Ces résultats corroborent ceux de la littérature.
Il n’y a à ce jour aucune donnée publiée sur l’immunité cellulaire post-vaccination anti-SARS-CoV-2 (précoce ou tardive) chez les participants avec Hypogammaglobulinémie et inclus dans la cohorte ANRS0001S COV-POPART.
Deux études ancillaires adossées au protocole général, ont été mises en place précédemment afin d’étudier plus précisément les réponses humorales et cellulaires dans la sous population Hypogammaglobulinémie de la cohorte : l’étude HYPOGAMMA, ayant comme objectif l’étude de la réponse vaccinale humorale à la vaccination Covid-19, en fonction des phénotypes cliniques et biologiques des participants (notamment le profil TFH si disponible) ; et l’étude VACCIDIHP, ayant comme objectif l’étude de la réponse cellulaire à M24 (ajout d’un prélèvement de sang total pour réalisation de tests d’immunité cellulaires à M24). Cependant, les objectifs d’inclusion n’ont pas pu être atteints pour ces deux études ancillaires en raison de leur mise en place tardive, certains participants cibles ayant déjà terminé leur suivi. Au regard de des faibles effectifs de sujets inclus dans ces deux études ancillaires, l’étude complémentaire ANRS GAMMACOV est mise en place pour analyser les données disponibles de l’ensemble des participants atteints de DIHP éligibles et ayant consenti à la réutilisation de leurs données.

L’objectif principal sera de comparer la qualité de la réponse humorale à la vaccination contre le SARS-CoV-2 en fonction du phénotype des patients DIHP et des profils immunologiques cellulaires T et B complets, et d’étudier sur le plan quantitatif la réponse vaccinale lymphocytaire T CD4 et CD8 à M24.
Les objectifs secondaires seront de : comparer la réponse vaccinale T entre répondeurs versus non-répondeurs sur le plan humoral à M24; comparer la réponse cellulaire T à M24 selon le nombre de doses vaccinales reçues, et selon la présence d’une infection à SARS-CoV2 post-vaccination ; corréler la réponse cellulaire T à M24 avec l’immunophénotypage B et T disponible à l’inclusion ; corréler les taux d’anticorps neutralisants et l’amplitude de la réponse lymphocytaire T à M24 ; étudier l’impact des souches virales sur l’ampleur de la réponse cellulaire T à M24 , si applicable.

Cette étude pourrait permettre d’adapter les stratégies vaccinales chez certains patients immunodéprimés hypogammaglobulinémiques et de réduire, dans certains cas, le recours aux gammaglobulines. Elle contribuera également à identifier des profils de patients atteints de déficit immunitaire commun variable susceptibles de répondre à la vaccination.

Le plan expérimental consistera en une étude de cohorte monocentrique, rétrospective, utilisant les échantillons biologiques et les données cliniques de participants présentant un DIPH inclus dans la population Hypogammaglobulinémie de la cohorte ANRS0001S COV-POPART. L’étude sera menée sur :
- Les données cliniques et biologiques issues des dossiers médicaux hospitaliers des participants, recueillies rétrospectivement ;
- Les données cliniques et biologiques de suivi longitudinal, produites dans le cadre de la cohorte ANRS0001S COV-POPART et deux de ses études ancillaires HYPOGAMMA et VACCIDIHP ;
- Les données issues de l’analyse de PBMC à l’inclusion, disponibles dans la biobanque de la cohorte ANRS0001S COV-POPART.