Etude de la variabilité spatiale et temporelle de la résistance aux antibiotiques d’Escherichia coli en France
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Le projet a pour but (i) d’analyser comment les fréquences de résistances aux antibiotiques chez E.coli (isolées dans des infections urinaires dans la communauté) varient au niveau spatial et temporelen fonction de l’usage d’antibiotiques, (ii) d’inférer les paramètres de diffusion spatiale des souches
d’E. coli, en particulier les souches les plus résistantes.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Autre(s) catégorie(s) de donnée(s) utilisée(s)
Les données auxquelles l’équipe projet souhaite accéder sont limitées aux informations nécessaires à la réalisation des objectifs scientifiques, à savoir :
● résultats microbiologiques (identification de l’espèce bactérienne, en particulier Escherichia coli) ;
● profils de sensibilité et de résistance aux antibiotiques (antibiogrammes) ;
● informations cliniques limitées associées à l’examen (symptomatologie, caractère récidivant) ;
● données démographiques de base (âge ou classe d’âge, sexe) ;
● code postal de résidence ;
● mois et année du prélèvement ;
● identifiant pseudonymisé permettant d’identifier plusieurs prélèvements chez un même individu ;
● pour une fraction restreinte des échantillons (500), données de séquençage génomique bactérien, portant exclusivement sur les génomes des souches isolées.
Profondeur des données : Les données concernent exclusivement la période allant du 1er janvier 2022 au 31 décembre 2026.
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Justification du recours à cette(ces) variable(s) sensible(s)
L'hypothèse de la recherche est que la variabilité spatiale d'usage d'antibiotiques et la diffusion entre communes et régions françaises pourrait être un déterminant majeur de la dynamique locale de la résistance aux antibiotiques.
La variable "code postal" pour chaque individu est ainsi nécessaire
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Responsable(s) de mise en oeuvre non cités comme responsable de traitement
Responsable de mise en oeuvre non cité comme responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
36
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
Le fournisseur de données, les laboratoires Biogroup remettent aux patients une lettre d’information sur l’utilisation de leurs données personnelles à des fins de recherche.
Une information collective sera publiée sur le site internet du CIRB, responsable du traitement des données dans le cadre de la présente réutilisation.
Les droits d’accès peuvent s’exercer auprès du responsable de la mise en oeuvre (François Blanquart), de la déléguée à la protection des données du CNRS.