Génomique et phylodynamique de l’épidémie de SARS-CoV-2 en France
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Les génomes viraux de SARS-CoV-2 issus de patients infectés constituent une source de données sous-exploitée en France. Des résultats préliminaires conduits à l’échelle de la France ont montré qu’il était possible d’estimer la durée de la période infectieuse, mais aussi le temps de doublement de l’épidémie et sa structure générale.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Source de données utilisées
Variables sensibles utilisées
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Numéro d'autorisation CNIL
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
3
Droits des personnes
Ce projet n'implique pas la personne humaine. Les séquences virales proviendront de reliquats d’échantillons utilisés dans le cadre du dépistage des infections par le SARS-CoV-2 par RT-PCR. Les informations relatives à chaque personne sont limitées à des données épidémiologiques non identifiantes (âge, sexe, département de résidence, date de prélèvement). De plus, il a été montré que la divergence entre séquences virales est très faible au niveau d’un pays. Dès lors, contrairement à d’autres virus tel que le virus de l’immunodéficience humaine, le niveau de diversité génétique viral n’est en aucun cas caractéristique de la transmission directe d’une personne à une autre... . En résumé :.. la nature des données transmises par les centres associés ne permet pas d’identifier les personnes,.. il est inutile de connaître l’identité des personnes pour mener à bien l’objectif de cette étude qui est purement épidémiologique,.. il n’existe aucun risque de découvrir d’autres pathologies que celle établie lors du diagnostic initial ni de reconstruire des réseaux de transmission fin, pouvant théoriquement compromettre l’anonymat des personnes.