Optimisation de la culture axénique de Coxiella burnetii à partir d’échantillons cliniques et environnementaux et comparaison génomique des souches isolées (pads25-356)

Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique

Finalité de l'étude

Objectifs poursuivis

Domaines médicaux investigués

Bénéfices attendus

La finalité de ce projet est conforme à l’intérêt public
Ce travail va apporter un bénéfice indirect pour les individus, direct pour la société et pour la communauté scientifique.
L’objectif principal de cette étude est d’améliorer la culture axénique d’un large éventail de souches humaines de Coxiella burnetii, et d’établir une corrélation entre les caractéristiques génomiques des souches isolées et leur capacité à se développer en milieu axénique ou leur préférence pour certaines lignées cellulaires.

Objectif secondaire: Optimiser la culture de routine de Coxiella burnetii applicable aux échantillons cliniques reçus dans le cadre des activités de diagnostic du laboratoire des agents infectieux de l'AP-HM.

Méthode:
Les chercheurs travailleront à partir d’échantillons de patients infectés par Coxiella burnetii (comme des valves cardiaques, des tissus vasculaires, du placenta ou des biopsies), recueillis uniquement lors d’actes médicaux déjà réalisés pour le diagnostic. Pour atteindre ces objectifs, différentes approches seront combinées : tests de nouvelles conditions de culture, observation de la croissance de la bactérie par microscopie électronique, et séquençage génétique complet des souches isolées. L’analyse des génomes permettra de mettre en relation les caractéristiques génétiques des souches avec leur capacité à se développer dans certains milieux ou à provoquer des formes graves chez l’homme. En comprenant mieux les liens entre la génétique et le comportement pathogène de Coxiella burnetii, cette recherche ouvrira de nouvelles perspectives pour améliorer le diagnostic de la fièvre Q, mieux anticiper sa gravité et, à terme, renforcer les moyens de lutte contre cette infection qui demeure un problème de santé publique en France et dans le monde. Profil de patients: Seuls seront inclus des patients infectés par Coxiella burnetii âgés de plus de 18 ans, pour lesquels des échantillons biopsiques auront été adressés au laboratoire des agents infectieux de l'AP-HM dans le cadre d'une demande de diagnostic de fièvre Q et confirmés positifs par les tests diagnostiques de routine ; et ne s'étant pas opposés à l'utilisation de leurs déchets d'activité de soins pour une réutilisation en recherche.