Travaux Pratiques pour le cours Master 2 « Advanced Immunology » _ TPAI
Objectif(s) de la recherche et intérêt pour la santé publique
Finalité de l'étude
Objectifs poursuivis
Domaines médicaux investigués
Bénéfices attendus
Les travaux pratiques du cours d'immunologie avancée offrent aux 24 étudiants issus d'universités prestigieuses une occasion unique de se familiariser avec les approches analytiques de pointe dans le domaine de l'immunologie humaine. Cet effort pédagogique contribue grandement à la formation des futurs chercheurs en sciences biomédicales et des médecins-chercheurs, en les confrontant à des problématiques scientifiques concrètes et en leur fournissant les connaissances nécessaires pour choisir les solutions analytiques appropriées afin d'y répondre.
L'objectif est de former les étudiants à sélectionner ces technologies et à intégrer les données immunologiques avec les paramètres cliniques des donneurs (âge, sexe) afin de développer des stratégies de découverte de biomarqueurs.
Population ciblée : Quatre donneurs sains pour chaque édition des travaux pratiques (4 individus par an)
Les échantillons de sang sont utilisés pour les travaux pratiques réalisés par les étudiants pour se familiariser avec les méthodes d’analyse. L'analyse des données issues de ces echantillons adopte une stratégie dédiée à chaque modalité expérimentale. Les acquisitions de cytométrie en flux et d'immunophénotypage sont traitées avec FlowJo, tandis que les données de cytométrie d'imagerie et les paramètres métaboliques (Seahorse XF Real-Time ATP Rate Assay, analyse du métabolisme cellulaire) sont analysés via les logiciels propriétaires des fabricants d'instruments.
Le profilage protéique multiplex par ELISA (xMAP, Bioplex200 technology) est quantifié sous Prism, et les données de transcriptomique bulk et unicellulaire (RNA-Seq et single-cell RNA-Seq) sont analysées à l'aide du logiciel R.
Cette approche méthodologique spécifique permet d'extraire, normaliser et interpréter les paramètres quantitatifs relatifs aux profils immunologiques, métaboliques et moléculaires.
Données utilisées
Catégories de données utilisées
Autre(s) catégorie(s) de donnée(s) utilisée(s)
La séropositivité au CMV
Source de données utilisées
Autre(s) source(s) de donnée(s) mobilisée(s)
Appariement entre les sources de données mobilisées
Variables sensibles utilisées
Recours au numéro d'identification des professionnels de santé
Plateforme utilisée pour l'analyse des données
Acteurs finançant et participant à l'étude
Responsable(s) de traitement
Type de responsable de traitement 1
Responsable de traitement 1
Localisation du responsable de traitement 1
Représentant du responsable de traitement 1
Calendrier du projet
Base légale pour accéder aux données
Encadrement réglementaire
Durée de conservation aux fins du projet (en années)
15
Existence d'une prise de décision automatisée
Fondement juridique
Article 6 du RGPD (Licéité du traitement)
Article 9 du RGPD (Exception permettant de traiter des données de santé)
Transfert de données personnelles vers un pays hors UE
Droits des personnes
La cohorte COSIPOP est une RIPH2 sous la promotion de l’Institut Pasteur. Les participants de la cohorte COSIPOP ont reçu une note d’information, les informant d’une possible réutilisation de leurs échantillons et de leurs données dans le cadre d’études ultérieures. Dans le cadre du projet TP AI, qui nécessite de programmer une visite de participation, une fiche d’information sera jointe au courriel de proposition de visite. Cette note d’information sera également fournie au participant lors de sa visite programmée. Les résultats globaux de l’étude seront communiqués via le site web de TP AI, où se trouvera également la note d’information de l’étude. Un délai minimum de 48 heures entre l’envoi de la fiche et la date de la visite sera respecté afin de permettre aux sujets de prendre connaissance de l’information.
Les participants pourront exercer leur droit via l'adresse mail de la cohorte COSIPOP (cosipop@pasteur.fr) ou du dpo de l'Institut Pasteur (dpo@pasteur.fr).