EDS@CHUBX - CHU de Bordeaux
Identification de la base
Base disponible via l'Entrepôt de la PDS
non
Responsable scientifique
Responsable de l'entrepôt de données du CHU de Bordeaux
eds@chu-bordeaux.frCaractéristiques des données
Objectif initial de la base
L'EDS du CHU de Bordeaux intègre l'ensemble des données collectées dans le cadre de la prise en charge des patients du CHU de Bordeaux.
Les objectifs de la collecte de ces données dans l'EDS sont les recherches, études et évaluation en santé (utilisation secondaire des données de santé).
Domaine médical
Population d'intérêt
La population d’intérêt comprend l’ensemble des patients venus au CHU de Bordeaux au moins une fois depuis 2010
Effectif cible
2,7 millions de patients, 22 millions de venues et 3,5 milliards d'observations
Géographie
La base de données couvre le bassin d'attractivité du CHU de Bordeaux
Profondeur historique
2005
Mise à jour
Collecte active – Tous les jours
Catégories des données
Source(s) de données/Origine
Périmètre des données
L'EDS du CHU de Bordeaux est basé sur le modèle de données i2b2 (base de données en étoiles). Ce dernier est composé de 3 tables pour les données liées aux patients et 3 tables pour les métadonnées. On dénombre plus de 1,4 millions de concepts différents intégrés. Des datamarts au format OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) sont également disponibles.
Nature des données
Données hétérogènes (structurées, semi-structurées et non structurées) et multimodales (clinique, biologiques, imagerie...)
Appariement avec le NIR
L’appariement correspond au croisement des données de la base avec les données de la base principale du Système National des Données de Santé (SNDS).
Le NIR (Numéro d’Inscription au Répertoire, ou encore numéro de sécurité sociale) peut être utilisé pour apparier deux bases de données entre elles.
Les NIR ne sont jamais détenus en clair mais de façon hachée, sous contrôle de la CNAM (Caisse Nationale d’Assurance Maladie)
La base de l’EDS du Centre hospitalier universitaire de Bordeaux n’est pas appariée avec les NIR.
Documentation de la base
Dictionnaires de données et documentation
Qualité
Processus de collecte
La collecte initiale des données est assurée par les professionnels de santé du CHU de Bordeaux dans le cadre de la prise en charge des patients.
Dans le cadre de l'EDS du CHU de Bordeaux, l'intégration des données depuis le soins est réalisée selon les étapes suivantes :
- Réplication des données des applications métiers dans un environnement répliqué ("data-lake"). Cette étape est assurée par les équipes de la Direction du Numérique du CHU de Bordeaux.
- Intégration des données depuis l'environnement répliqué vers l'EDS du CHU de Bordeaux. Il s'agit de la mise en place d'ETL (Extract, Transform and Load) correspondant à l'extraction, la transformation et le chargement des données dans un format compatible avec la structure de données cible. Au cours de ce processus, les données sont pseudonymisées. Cette étape est assurée par les ingénieurs de l'équipe en charge de la mise en œuvre de l'EDS du CHU de Bordeaux (équipe interne à l'établissement).
Contexte de saisie le cas échéant
Les données contenues dans l'EDS du CHU de Bordeaux peuvent être annotées manuellement dans le cadre de réutilisation (études ponctuelles) au sein de cahiers d'observations électroniques (eCRF).
Ces données annotées permettent d'enrichir les données de l'EDS du CHU de Bordeaux.
Processus qualité
Les étapes d'extraction des données sont qualifiées par l'équipe chargée de la mise en œuvre de l'EDS. Un suivi de l'intégration et de la cohérence des données est réalisé au fil de l'eau.
Dans le cadre de la participation à des réseau fédéré (DARWIN-EU et EHDEN) la cohérence et la complétude des données sont évaluée tous le 6 mois (https://catalogues.ema.europa.eu/node/1025/administrative-details)
Délégué à la protection des données (DPD)
Réglementaire
Encadrement réglementaire de la base
Autorisation réglementaire de la Commission Nationale de l'Informatique et des Libertés (CNIL)
Durée de conservation des données
30 ans
Modalités d’information des personnes concernées
- Information générale
- Campagne d’affichage dans l’ensemble des lieux accueillant des usagers ;
- Au travers des médias locaux, presse régionale ;
- Campagne d'information via les réseaux sociaux LinkedIn et X (Twitter) ;
- Information par mail au fil de l'eau des patients de la file active du CHU de bordeaux ;
- Présentation de l'EDS sur le site internet du CHU de Bordeaux, accessible aux usagers ;
- Portail de transparence, accessible sur le site internet du CHU de Bordeaux ;
- Vidéo « Patient Partenaire » présentant les activités et finalités de l'EDS (chaîne YouTube du CHU de Bordeaux / site internet du CHU de Bordeaux) ;
- Information sur l’utilisation secondaire des données de santé dans le livret d’accueil du CHU de Bordeaux.
- Portail de transparence sur le site internet de l'établissement regroupant par domaine de spécialité la liste des études et recherches mises en œuvre au sein du CHU de Bordeaux. Si un patient le souhaite, notamment pour exercer ses droits, il dispose sur le portail d'une possibilité de contacter l’investigateur principal ou le DPO de l’établissement
- Dérogation patients historiques : une dérogation à l'information individuelle des patients admis antérieurement à la constitution de l’EDS du CHU de Bordeaux est invoquée par le responsable de traitement. Conformément aux travaux et observations sur les dynamiques de prise en charge des patients et de l’utilisation de leurs dossiers, on peut considérer cette sous-file active comme constituée de « perdus de vue ». Notamment, compte-tenu du fait que la probabilité de retour des patients est quasi-nulle au-delà de cinq années après leur dernière venue, que leurs coordonnées de contact sont potentiellement obsolètes, et que l'effort que nécessiterait leur sollicitation est déraisonnable sur le plan pratique et financier. La dérogation invoquée concerne la file active des patients qui ne sont pas revenus au CHU de Bordeaux depuis 2020.
- Patients décédés : Sauf récupération de directives anticipées s'opposant à l'utilisation secondaire des données, l'utilisation des données des patients décédés ne requiert pas de mesure particulière. Une opération de recouvrement des personnes décédées en dehors du CHU de Bordeaux est mise en œuvre régulièrement sur la base des données de décès publiées par l'INSEE (Institut national de la statistique et des études économiques)
Exercer ses droits
A travers les différents supports d'information (livret d'accueil, site internet du CHU de Bordeaux, campagne d'affichage, information unique individuelle, portail de transparence...), les personnes concernées sont informées de l’utilisation et de l’exploitation secondaire des données à caractère personnel à des fins de recherche, étude, évaluation, de soutien à l’information médicale, de support aux vigilances et elles peuvent directement solliciter un exercice des droits à partir de l'adresse mesdonneespersonnelles@chu-bordeaux.fr ou à partir des coordonnées de l'investigateur principal disponibles au niveau du portail de transparence. Le portail de transparence et les modalités d'exercice des droits sont mentionnés dans l’ensemble des canaux d’information, notamment la note d’information individuelle et préalable.